Department of Biomedical Sciences, SNU

연구

연구분야
본 연구실은 모든 종류의 10x 플랫폼(scRNAseq, snRNAseq, scATAC, mutiome)을 구축하여 직접 데이터 생산및 분석을 진행하고 있으며 Targeted single cell proteomics (CyTOF) 는 Mount Sinai HIMC에서 데이터를 생산하고 있음. Spatial transcriptomics platform 으로는 GeoMX를 세팅하여 많은 데이터를 생산 분석하고 있으며, 다양한 국내외 네트워크(피부과, 면역학, 정밀오믹스)를 적극적으로 이용하여 다양한 국가/민간 연구개발 과제를 수행중에 있음.
만성염증성질환/급성바이러스감염(COVID19)/종양면역반응에서의 면역관용현상, 특히 조절T세포를 중심으로 한 다양한 면역반응에 관심이 있으며,
이식면역학/이종이식/CD40-CD40L신호전달과 관련해서도 전문성이 있음. 의과대학 졸업생에게는 의사과학자가 될수 있는 방향으로, 비의과대학졸업생에게는 의사들과 소통할 수 있는 전문성 있는 독립연구자가 될수 있는 방향으로 성장시켜 나갈 계획임
전공분야 핵심단어
scRNA seq, Spatial transcriptomics, Immune tolerance, regulatory T cell

학력

  • 2007 학사, 서울대학교 의과대학 (의학)
  • 2011 석사, 성균관대학교 의과대학 (피부과학)
  • 2017 박사, 서울대학교 대학원 (면역학)

주요 경력

  • 03/2023- 조교수 (의사-과학자,Physician-Scienist), 서울대학교 대학원 의과학과
  • 09/2022- 조교수 (의사-과학자,Physician-Scienist), 서울대학교 의과대학 미생물학교실
  • 08/2021-08/2022 연구부교수, 서울대학교 의학연구원 유전체의학연구소 & 감염병 연구소
  • 03/2021-07/2021 선임연구원, 서울대학교 의학연구원 감염병 연구소
  • 03/2020-02/2021 Research fellow, 삼성서울병원 피부과
  • 11/2017-10/2019 Instructor (Pfizer fellowship), Department of Dermatology, Precision Immunology Institute, Icahn School of Medicine at Mount Sinai - New York, NY
  • 2008-2011 Clinical Associate (레지던트), 삼성서울병원 피부과
  • 2007 인턴 (Work valuation: 2/205), 서울대학교병원

주요 논문

  1. Lim Y, Kang SJ, Cho BK, Kim HJ, Mun JH, Roh MR, Gulati N, Yang HJ, Moon JH, Won CH, Park CG. Intra-tumoral heterogeneity and immune escape of melanoma arising from congenital melanocytic nevus revealed by spatial gene expression profiling. J Eur Acad Dermatol Venereol. 2022 Dec;36(12):e1044-e1047
  2. Joo EH, Bae JH, Park JH, Bang YJ, Han J, Gulati N, Kim JI, Park CG, Park WY and Kim HJ. Deconvolution of Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma With Single-CellRNA-Seq Using Frozen Archived Skin Tissue Reveals New Subset of Cancer Associated Fibroblast. Front. Immunol. 2022; 13:856363
  3. Kim HJ**, Shim JH, Park JH, Shin HT, Shim JS, Jang KT, Park WY, Lee KH, Kwon EJ, Jang HS, Yang H, Lee JH, Yang JM, Lee D. Single-cell RNA sequencing of human nail unit defines RSPO4 onychofibroblasts and SPINK6 nail epithelium. Commun Biol. 2021 Jun 7;4(1):692
  4. Czarnowicki T, Kim HJ, Villani AP, Glickman J, Duca ED, Han J, Pavel AB, Lee BH, Rahman AH, Merad M, Krueger JG, Guttman-Yassky E. High-dimensional analysis defines multicytokine T-cell subsets and supports a role for IL-21 in atopic dermatitis. Allergy. 2021 Apr 5
  5. He H, Suryawanshi H, Morozov P, Gay-Mimbrera J, Del Duca E, Kim HJ, Kameyama N, Estrada Y, Der E, Krueger JG, Ruano J, Tuschl T, Guttman-Yassky E. Single-cell transcriptome analysis of human skin identifies novel fibroblast subpopulation and enrichment of immune subsets in atopic dermatitis. J Allergy Clin Immunol. 2020 Jun;145(6):1615-1628